測量系統(tǒng)分析（MSA）的強制性
IATF 16949強制要求對控制計劃中的所有檢驗、測量和試驗設備進行統(tǒng)計研究，即MSA，包括偏倚、線性、穩(wěn)定性、重復性和再現(xiàn)性（GR&R）。這是確保測量數據可靠、從而做出正確判斷的基礎。ISO 9001僅要求測量設備應被校準或檢定，以確保其有效性，但并未強制要求對測量系統(tǒng)的統(tǒng)計特性（如GR&R）進行深入研究并保留證據。

全面生產維護（TPM）與設備管理
IATF 16949要求組織為所有設備（包括工裝、模具）制定全面的預防性維護計劃，并鼓勵使用預見性維護方法。它關注設備的整體效率（OEE）。而ISO 9001的要求是基礎性的，主要為“組織應確定、提供和維護其過程運行所需的基礎設施”，以確保產品符合要求。它沒有詳細規(guī)定維護的類型或方法，組織自主選擇的余地很大。

文件化信息的詳細程度與強制性
IATF 16949的文件化要求遠比ISO 9001具體和繁多。它明確要求保留眾多特定過程的記錄證據，如：員工激勵、培訓有效性、設計輸入、供應商選擇、追溯性、校準、內部審核、管理評審、作業(yè)準備驗證、全尺寸檢驗等。ISO 9001采用了一種更加靈活的方法，要求組織為確保過程有效策劃、運行和控制所需的文件化信息，其詳細程度由組織自行決定，給予了更大的自主空間。

顧客特定要求的全面識別與無縫融入
全面識別并滿足所有顧客特定要求是挑戰(zhàn)性的任務。難點在于動態(tài)跟蹤：各主機廠的CSR文件時常更新，組織需建立機制確保始終獲取新版本。其次在于轉化落地：需將數十甚至上百頁的CSR條款逐一解讀，并轉化為內部的流程、作業(yè)指導書或質量控制點，確保在日常運營中得到嚴格執(zhí)行。任何遺漏或理解偏差都會導致嚴重不符合。這對于擁有眾多客戶的組織來說，是一個持續(xù)且繁瑣的管理挑戰(zhàn)。

供應鏈管理的深度掌控與績效提升
對許多組織而言，有效管理供應商是一大難點。這遠不止于簡單的來料檢驗，而是需要建立包括供應商選擇、績效監(jiān)控、現(xiàn)場審核、問題解決和持續(xù)開發(fā)在內的完整體系。難點在于如何對供應商，尤其是強勢或單一的供應商施加有效影響，推動其提升質量、交付和成本績效。企業(yè)需證明其對供應商問題采取了升級流程（如審核、罰款、幫扶直至淘汰），而不僅僅是妥協(xié)和讓步，這需要強大的采購管理和博弈能力。

管理層的真正理解、參與與驅動
高管理者的參與絕不能于提供資源和出席會議。難點在于讓管理層真正理解其角色職責：不僅要熟悉體系績效、公司質量目標達成情況，更要能闡述如何基于風險思維進行決策、如何推動持續(xù)改進、如何將體系與業(yè)務戰(zhàn)略相結合。審核員會通過與高層深入面談來評估這種“領導力與承諾”的真實性。管理層若僅停留在口頭支持，無法展現(xiàn)其驅動作用，將直接影響認證審核的結果。