有些代理記賬公司沒有與委托單位簽訂正式的委托代理合同，對(duì)雙方的權(quán)利、義務(wù)缺少明確的規(guī)定，在實(shí)際工作中遇到異議時(shí)，往往無(wú)法分清責(zé)任。因此在選擇代賬公司的時(shí)候，企業(yè)就要更加謹(jǐn)慎。

財(cái)務(wù)軟件需要到財(cái)政局備案方可使用，有的代理記賬單位沒有采用財(cái)政部批準(zhǔn)的財(cái)務(wù)軟件來(lái)替代手工記賬。 會(huì)計(jì)資料交接麻煩、不夠規(guī)范。代理記賬單位在接受委托單位的會(huì)計(jì)原始憑證及資料時(shí)，沒有辦理交接手續(xù)，發(fā)現(xiàn)遺失或毀損時(shí)無(wú)法查找。 代理記賬單位通常是定期或定時(shí)上門服務(wù)，日常業(yè)務(wù)可通過電話溝通，會(huì)計(jì)不是隨時(shí)在單位辦理和咨詢業(yè)務(wù)

代理記賬機(jī)構(gòu)設(shè)立不規(guī)范。代理記賬機(jī)構(gòu)有3名以上持有會(huì)計(jì)從業(yè)資格證書的專職從業(yè)人員，且主管代理記賬業(yè)務(wù)的負(fù)責(zé)人具有會(huì)計(jì)師以上技術(shù)職稱資格。但實(shí)際執(zhí)行中，相當(dāng)部分的代理記賬機(jī)構(gòu)不符合此規(guī)定。

代理記賬機(jī)構(gòu)內(nèi)部管理混亂。實(shí)際執(zhí)行中很多代理記賬業(yè)務(wù)操作不規(guī)范、內(nèi)部管理制度不健全現(xiàn)象十分普遍，部分代理記賬機(jī)構(gòu)的內(nèi)部管理制度即使制定也是形同虛設(shè)。

委托代理記賬的委托人應(yīng)當(dāng)履行下列義務(wù)： （1）對(duì)本單位發(fā)生的經(jīng)濟(jì)業(yè)務(wù)事項(xiàng)，應(yīng)當(dāng)填制或者取得符合國(guó)家統(tǒng)一的會(huì)計(jì)制度規(guī)定的原始憑證； （2）應(yīng)當(dāng)配備專人負(fù)責(zé)日常貨幣收支和保管； （3）及時(shí)向代理記賬機(jī)構(gòu)提供真實(shí)、完整的原始憑證和其他相關(guān)資料； （4）對(duì)于代理記賬機(jī)構(gòu)退回的要求按照國(guó)家統(tǒng)一的會(huì)計(jì)制度規(guī)定進(jìn)行更正、補(bǔ)充的原始憑證，應(yīng)當(dāng)及時(shí)予以更正、補(bǔ)充。

業(yè)務(wù)范圍 1、代理各個(gè)稅種的納稅申報(bào)，代理企業(yè)納稅情況自查及清算各種稅款業(yè)務(wù); 2、代理企業(yè)整體稅務(wù)安排、投資項(xiàng)目稅收評(píng)估，代理制作涉稅文書。 3、建立企業(yè)納稅核算體系用辦稅制度，為企業(yè)設(shè)計(jì)財(cái)務(wù)制度。 4、協(xié)助企業(yè)進(jìn)行股份制改及企業(yè)間兼并、收購(gòu)工作，代理設(shè)計(jì)經(jīng)營(yíng)管理制度。 5、為企業(yè)提供報(bào)表分析，提供其他管理建議。 6、委托人要求的其他常年代理業(yè)務(wù)。 有百分之九十八的代理記賬機(jī)構(gòu)會(huì)提供整理原始憑證、編制會(huì)計(jì)憑證、登記賬冊(cè)、編制會(huì)計(jì)報(bào)表、納稅申報(bào)五項(xiàng)基本服務(wù)。